edc是什么化學試劑的簡稱 edc是什么化學材料?很多人不了解,今天本站為大家帶來相關內容,下面小編為大家整理介紹。
固相合成多肽的聚合物載體及連接分子
1.聚合物載體固相合成肽需要一個固相載體和一個將固相與反應物連接起來的接頭。固相合成的成功取決于載體和連接體的正確選擇。用于固相合成肽的載體多為聚苯乙烯及二乙烯基苯和苯乙烯共聚物等高聚物的衍生物,如氯 樹脂、Pam樹脂、王氏樹脂和氨基樹脂等.樹脂的溶脹狀態對縮合試劑和羧基組分的自由擴散、肽鏈間的聚集及其他與縮合反應有關的因素有明顯的影響。為了使載體具有良好的溶脹性能,有足夠大的網絡空間容納不斷增長的較長肽鏈,便于反應物進入載體內部,一般采用交聯度為1% ~ 2%的聚苯乙烯珠樹脂或微孔樹脂。
2.連接分子固相合成肽使用了與不同連接分子結合的聚合物,這些連接分子是含有氯甲基、巰基甲基、酰氯、對苯甲酰基、芳基磺酰氯、烯丙基、琥珀酰基、鄰硝基苯甲醇和二苯基氯硅烷的雙功能化合物。一個理想的接頭分子在整個合成過程中必須非常穩定,并且合成后可以定量切割,不會破壞合成的目標分子。根據與樹脂連接的肽的C-末端的結構類型,合適的接頭分子應該被切割以產生相應的衍生物,例如羧酸、酰胺或氨基醇。
固相合成多肽的檢測
即使偶聯技術高效,也不能保證100%的酰化反應。此外,當遇到空間位阻或 2層狀序列時,偶聯反應的效率大大降低。聚合物載體上總有缺失或截短的多肽鏈,它們在釋放時也會進入產品,給分離帶來很大困難。所以固相肽合成時每個氨基酸的縮合率都要達到99.9%,尤其是長肽,否則產品會很不純。因此,監控每個反應步驟的進展非常重要。(杭州專肽生物有20多年的固相合成經驗,可以滿足大部分客戶的需求。)
1 定性顏色反應茚三酮比色法(Kaiser法)是通過茚三酮顯色反應快速測定樹脂上的氨基,從而判斷酰化反應是否完全。茚三酮法檢測聚苯乙烯樹脂中氨基的靈敏度可達5 mol/g,以此靈敏度可檢測縮合反應是否超過99%。檢測茚三酮時,由于末端氨基酸殘基和序列的不同,顏色強度也不同。天冬氨酸(Asp)和天冬酰胺(Asn)會產生淡藍色或淺棕色。顯色劑2,4,62三硝基苯磺酸與樹脂上的氨基反應呈橙紅色,靈敏度為5mol/g樹脂。
Kaiser試劑包括:
a、6%茚三酮的乙醇溶液
b、80%苯酚的乙醇溶液
c、2%0.001MKCN的2%吡啶溶液
制備的吡啶需要用茚三酮處理,然后重新蒸熟后才能使用。檢測過程中,取少量樹脂,分別加入A、B、C各2-3滴,100加熱1-2分鐘。如果溶液呈藍色,或者樹脂呈藍色或紅棕色,說明還有游離氨基;否則,連接完成。檢測游離氨基還有其他方法:三硝基苯磺酸法、苦味酸法、溴芬法等。
可用于測定肽接枝2 定量自由氨基檢測 水楊醛法 后樹脂上殘留氨基的量和脫保護基后氨基的總量,并可定量檢測縮合反應和脫保護基反應是否完全。如果不完整,可以及時反復處理。2%水楊醛和6%吡啶乙醇溶液與樹脂上的氨基反應(60,30 ~ 35分鐘)。清洗后,用5%芐胺乙醇溶液代替水楊醛(60,30分鐘)。用芐胺乙醇溶液稀釋后,在315nm處讀取光吸收值,計算氨基數量(=4.36對于NH2大于0.15mol/mg樹脂的樣品,該方法的相對偏差小于5%。
在3 HPLC檢測部分保護的中間肽多肽的合成過程中,將少量的肽樹脂(3 ~ 10 mg)裂解,用乙醚沉淀,溶解在適當的溶劑中,直接進行高效液相色譜分析。當肽I
反應溶劑
二甲基甲酰胺(DMF)和二氯甲烷(DCM)是多肽固相合成中常用的溶劑,尤其是DMF因其對反應產物和產物的高溶解性而被廣泛應用于許多反應體系中。DMF雖然溶解度較好,但沸點較高,需要減壓蒸發。此外,副產物N-酰基脲在高介電常數的溶劑中容易產生[〔DMF,乙腈(CH3CN),二甲基亞砜(DMSO),H2O等。],而在低介電常數的溶劑(CH2Cl2、CCl4、C6H6等)中不易產生。).在非極性溶劑中,N-保護氨基酸能迅速與DCC反應生成對稱酸酐。所以只要能溶解反應物,就盡量選擇介電常數低的溶劑。在固相合成中,DCM多用作溶劑,它有兩個優點:比DMF消旋率小,N-酰基脲生成慢。當羧基成分難以溶解時,可以加入幾滴再蒸的DMF幫助溶解。
縮合試劑主要有:碳化二亞胺型,鹽型(脲)
碳二亞胺型
主要有DCC、DIC、EDC。HCl等。將DCC用于反應,并將反應中產生的DCU溶解在DMF中。
度很小,產生白色沉淀,所以一般不用在固相合成中,但是由于其價格便宜,在液相合成中,可以通過過濾除去,應用仍然相當廣泛。EDC.HCl因為其水溶解性的特點,在多肽與蛋白的連接中使用比較多,而且也相當成功。但是該類型的縮合試劑的一個最大的缺點,就是如果單獨使用,會有比較多的副反應,但是研究表明如果在活化過程中添加HOBt,HOAt等試劑,可以將其副反應控制在很低的范圍。鎓鹽型
鎓鹽型縮合試劑反應活性高,速度快,現在使用非常廣泛,主要包括:HBTU,TBTU,HATU,PyBOP等。該試劑使用過程中需要添加有機堿,如,二異丙基乙胺(DIEA),N-甲基嗎啉(NMM),該試劑加入后,才能活化氨基酸。
固相合成過程
1、羥基樹脂為載體的合成方法(Wang樹脂為例:圖1)
Wang樹脂、PAM樹脂、HMPA樹脂、Sasrin樹脂等均在Linker結構中含有芐醇基。多數情況下把預制的N一保護氨基酸的對稱酸酐及催化劑DMAP(對二甲氨基吡啶)與羥基樹脂一起反應。在這種成鍵反應中。DMAP是必需的,但也由此帶來一些麻煩。例如,當某些位阻較大、反應活性較低的Fmoc-氨基酸需要較長的反應時間,而且DMAP的純度又不理想時。會發生部分Fmoc基被脫除,生成部分二肽的麻煩。更常見的危險是當Cys及His作為C端第一個氨基酸與羥基樹脂反應時,DMAP往往使這兩種氨基酸發生消旋化。對此,解決辦法是改用Cl-Trt樹脂與這兩種氨基酸鍵合,同樣可以生成酯型Linker。另一種解決辦法是用MSNT試劑,可以有效地免除Cys, His與多種羥基樹脂鍵合時的消旋化危險。
圖1 固相多肽合成
2.以三苯甲基樹脂樹脂為載體的合成方法(圖2)
三苯甲基(trt)樹脂含有三重芐基結構,因此反應活性極高。一般用等摩爾量的保護氨基酸及4倍量的DIEA與Trt樹脂混在二氯甲烷中,室溫反應30-12Omin即達完全。對于未反應完全的位點,可用甲醇封住位點。基于Trt Linker的溫和鍵合及溫和裂解特點,在此種樹脂上進行膚片段縮合及全保護基膚片段制備是較理想的方式。
圖2 固相多肽合成
FMOC固相合成Glu-Trp
3以氨基樹脂為載體的合成方法
MBHA樹脂、PAL樹脂、Knorr樹脂、Rink-NH2樹脂等均在Linker中含有可與羧酸反應的氨基。C端第一個氨基酸與之鍵合的反應條件與接肽循環中的操作完全相同。如果以DCC為縮合劑,一般先將N-保護氨基酸與DCC、HOBT混于溶劑(DMF、THF、DCM等)中,生成氨基酸的HOBT活潑酯,放置3-5h,待活化反應基本完全后濾除副產物DCU沉淀,把羧基活化組分溶液與氨基樹脂混合進行鍵合反應。此步反應有兩點事項值得注意:①多數氨基樹脂的氨基并非以游離狀態出售。有的氨基是以鹽酸鹽的形式,有的則帶有臨時保護基(如Fmoc , Boc等),因此在與C端第一個氨基酸鍵合之前必須進行相應的中和或脫除臨時保護基的處理;②氨基酸活化組分的用量應大大高于氨基樹脂組分,一般的摩爾比為(2-5):1,目的是使鍵合反應接近100% ,因為未被酰化的氨基樹脂無法從產物中清除出去。使用大大過量的構件是所有固相有機合成的共同之處。
除了DCC之外,其他常見的縮合劑還有DIC、EDC、EEDQ、HBTU等。
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